27 tháng 8 năm 2019
Liskin Swint-Kruse đặc trưng trong Hội thảo sinh hóa và sinh lý phân tử tỷ số bóng đá olympico ngày 28 tháng 8
Được gửi bởi Hóa sinh và Sinh lý tỷ số bóng đá olympic phân tử
Liskin Swint-Kruse, Giáo sư Sinh hóa và Sinh tỷ số bóng đá olympic Phân tử tại Trung tâm Y tế Đại tỷ số bóng đá olympic Kansas, là người nói nổi bật về hóa sinh và Hội thảo sinh tỷ số bóng đá olympic phân tử vào Thứ Tư, ngày 28 tháng 8. trong 120 Ackert Hall.
Swint-Kruse đã kiếm được bằng tiến sĩ về sinh hóa của Đại tỷ số bóng đá olympic Iowa năm 1995 dưới sự chỉ đạo của Andy Robertson. Cô đã thực hiện công việc sau tiến sĩ đa ngành tại Trung tâm Sinh tỷ số bóng đá olympic Tính toán W. M. Keck thuộc Kathy Matthews, Đại tỷ số bóng đá olympic Rice; và Monte Pettitt, Đại tỷ số bóng đá olympic Houston. Sau khi làm nhà khoa tỷ số bóng đá olympic nghiên cứu tại Đại tỷ số bóng đá olympic Rice, năm 2004, cô chuyển đến Trung tâm Y tế Đại tỷ số bóng đá olympic Kansas với tư cách là Trợ lý Giáo sư tại Khoa Sinh hóa và Sinh tỷ số bóng đá olympic Phân tử, nơi cô hiện là giáo sư và chủ tịch. Phòng thí nghiệm của cô nghiên cứu sự phát triển của biến thể chức năng protein, có các ứng dụng cho kỹ thuật y tỷ số bóng đá olympic và protein được cá nhân hóa và được tài trợ bởi Quỹ W. M. Keck và NIH. Cô ấy có thêm lợi ích nghiên cứu trong việc kiểm soát phiên mã sự chuyển hóa của vi khuẩn.
Trình bày: Y tỷ số bóng đá olympic được cá nhân hóa bị cản trở bởi khả năng hạn chế của chúng tôi để dự đoán kết quả chức năng của thay đổi axit amin. Cuối cùng, nhiều thuật toán máy tính đã được viết để phân tích trình tự axit amin của họ protein. Chúng dựa trên lý do rằng "những thay đổi phát sinh trong quá trình phát triển của biến thể chức năng có thể được sử dụng để dự đoán kết quả đột biến." Với các phương pháp này, các đột biến thảm khốc tại các vị trí được bảo tồn có thể được xác định dễ dàng. Tuy nhiên, dự đoán xác định kết quả thay thế tại các vị trí không được bảo quản vẫn là một thách thức. Chúng tôi đã xem xét các giả định cơ bản được chia sẻ bởi nhiều thuật toán tính toán. Từ so sánh với thí nghiệm, chúng tôi thấy rằng các giả định không áp dụng cho một nhóm axit amin không được bảo quản nhất định; Chúng tôi ước tính các vị trí này có thể bao gồm 25% trình tự của protein. Sự phức tạp bổ sung bao gồm: (i) ảnh hưởng của việc xác định các ngưỡng tính toán và sinh tỷ số bóng đá olympic xác định các axit amin "quan trọng"; (ii) sự xuất hiện của nhiều mô hình khác nhau của axit amin trong dữ liệu tiến hóa; (iii) kết quả đột biến "biến dạng" xảy ra tại một số trang web không được bảo quản; (iv) epistocation (không phù hợp) trong số nhiều đột biến; và (v) thực tế là một phần lớn axit amin protein protein góp phần vào chức năng tổng thể. Các lĩnh vực này cung cấp định hướng cho các nghiên cứu thực nghiệm trong tương lai.