ngày 6 tháng 7 năm 2011
Khám phá bức tranh lớn hơn trong nhiễm bóng đá số dữ liệu thể: Nhóm nghiên cứu tìm thấy sự tương đồng trong bộ gen trên nhiều loài; thú mỏ vịt vẫn không đúng chỗ
Bằng cách ánh xạ bóng đá số dữ liệu bộ gen khác nhau lên trục X-Y, một nhóm bao gồm chủ yếu là bóng đá số dữ liệu nhà nghiên cứu của Đại học bang Kansas đã phát hiện ra rằng Charles Darwin và một con ruồi giấm-trong số bóng đá số dữ liệu sinh vật khác-có rất nhiều về mặt di truyền.
Khám phá của chúng, "Kích thước nhiễm bóng đá số dữ liệu thể trong các loài sinh vật nhân chuẩn lưỡng bội ở độ dài trung bình với một ranh giới được bảo tồn", gần đây đã được công bố trên tạp chí Sinh học phân tử và tiến hóa. Nó nêu chi tiết một dự án so sánh 886 nhiễm bóng đá số dữ liệu thể ở 68 loài sinh vật nhân chuẩn - các sinh vật có tế bào chứa một hạt nhân và được bao quanh bởi màng tế bào.
Vì nhiễm bóng đá số dữ liệu thể là khối xây dựng di truyền cho một sinh vật và các đặc điểm của nó, thông tin sẽ có lợi khi hiểu các thành phần cốt lõi của sự tiến hóa sinh học-đặc biệt là trong di truyền học và tiến hóa bộ gen, Jianming Yu, phó giáo sư về nông nghiệp tại bang K nói. Với dữ liệu này, các nhà khoa học giờ đây có thể dự đoán tốt hơn sự thích nghi tiến hóa của một sinh vật.
"Về cơ bản, tất cả điều này có nghĩa là nếu số lượng nhiễm bóng đá số dữ liệu thể của một loài có thể được đưa ra, kích thước tương đối của tất cả các nhiễm bóng đá số dữ liệu thể có thể được biết ngay lập tức," Yu nói. "Ngoài ra, nếu bạn cho tôi biết kích thước bộ gen trong cặp cơ sở nhiễm bóng đá số dữ liệu thể, tôi có thể cho bạn biết độ dài cặp cơ sở của mỗi nhiễm bóng đá số dữ liệu thể."
Theo Yu, phát hiện đáng ngạc nhiên nhất là mô hình phân phối cực kỳ nhất quán của nhiễm bóng đá số dữ liệu thể, kết quả là so sánh các bộ nhiễm bóng đá số dữ liệu thể đầy đủ - được gọi là bộ gen - của 68 sinh vật nhân chuẩn ngẫu nhiên. Nhóm nghiên cứu nhận thấy rằng gần như mọi bộ gen đã hình thành hoàn hảo một đường cong S gồm chiều dài nhiễm bóng đá số dữ liệu thể tăng dần khi được đặt trên trục X-Y được tiêu chuẩn hóa.
Tuy nhiên, để đạt được những phát hiện này, nhóm nghiên cứu bắt đầu bằng cách so sánh bóng đá số dữ liệu bộ gen khác nhau của bóng đá số dữ liệu loài từ nhiều sinh vật, tìm kiếm sự tương đồng. bóng đá số dữ liệu bộ gen được chọn là từ sinh vật nhân chuẩn;
Từ đó, nhóm nghiên cứu đã xem xét cụ thể các nhiễm bóng đá số dữ liệu thể của 68 bộ gen eukaryote ngẫu nhiên. Điều này đã được quan sát 886 nhiễm bóng đá số dữ liệu thể, 22 trong số đó là tự động của con người - bất kỳ nhiễm bóng đá số dữ liệu thể nào khác ngoài nhiễm bóng đá số dữ liệu thể giới tính.
bóng đá số dữ liệu nhà nghiên cứu đã đặt từng bộ gen eukaryote được giải trình tự đầy đủ lên trục X-Y, hy vọng tìm thấy sự tương đồng giữa bóng đá số dữ liệu sinh vật khác nhau. Để giúp khái quát một lượng lớn thông tin, biểu đồ trục X-Y đã được tiêu chuẩn hóa với từng loài.
"Nó đã loại bỏ hiệu ứng tỷ lệ và có thể so sánh một loài với vài chục nhiễm bóng đá số dữ liệu thể với một loài có ít nhiễm bóng đá số dữ liệu thể hơn nhiều", Xianran Li, cộng tác viên nghiên cứu về nông học.
Đó là khi nhóm nhận thấy mẫu phân phối nhất quán gây sốc.
"Chúng tôi không thể tin rằng lần đầu tiên cốt truyện được tạo ra", Chengsong Zhu, cộng tác viên bóng đá số dữ liệu về nông học.
Bộ gen duy nhất lệch khỏi hình thành đường cong S là của loài thú mỏ vịt-một sinh vật có đặc điểm của chim, bò sát, động vật có vú, động vật lưỡng cư và cá-và của chim. Các loài chim là duy nhất bởi vì ngoài các trình tự nhiễm bóng đá số dữ liệu thể thông thường của chúng, chúng chứa một tập hợp các chuỗi minichromosome bổ sung, theo Zhongwei Lin, cộng tác viên nghiên cứu về nông học.
Bằng cách tìm thấy sự phân bố bình thường trong gần như tất cả các bộ gen mà họ đã sử dụng, các nhà di truyền học giờ đây có thể nói rằng nếu một loài có một số lượng nhiễm bóng đá số dữ liệu thể cụ thể, các nhiễm bóng đá số dữ liệu thể phải được phân phối theo thứ tự này do sự phân phối của phân phối và phân phối tế bào. Dịch vụ nghiên cứu nông nghiệp-nông nghiệp.
"Việc tích hợp sinh học và thống kê có những lời hứa rất lớn để có được những hiểu biết sâu bóng đá số dữ liệu từ dữ liệu genomic và quá trình sống", Min Zhang, phó giáo sư thống kê từ Đại học Purdue và đồng tác giả của bài báo.
"Chúng ta đang ở độ tuổi bộ gen, nơi bóng đá số dữ liệu trình tự và máy tính liên tục chạy và hoàn thành bóng đá số dữ liệu chuỗi bộ gen mới mỗi ngày," Yu nói. "Chúng tôi mong đợi thông tin này có thể giúp ích khi tìm ra những điểm tương đồng trong bóng đá số dữ liệu bộ gen đó. Loại phân tích rộng này giữa bóng đá số dữ liệu loài, ranh giới phân loại và kỷ luật thực sự thú vị về mặt khám phá bóng đá số dữ liệu nguyên tắc cơ bản từ dữ liệu bộ gen."
Dự án được hỗ trợ tài trợ từ Chương trình xuất bóng đá số dữ liệu mục tiêu của K-State, Quỹ khoa học quốc gia, Viện Y tế Quốc gia, Bộ Quốc phòng Hoa Kỳ và một khoản trợ cấp hạt giống thông qua Công viên khám phá của Đại học Purdue.
bóng đá số dữ liệu nhà nghiên cứu K-State khác bao gồm Yun Wu, Trợ lý nghiên cứu về nông học và bài hát Weixing, Trợ lý Giáo sư Thống kê. Cũng hợp tác trong nghiên cứu là bốn nhà sinh học và nhà thống kê khác từ Đại học Purdue, Đại học Minnesota và Đại học Cornell.
bóng đá số dữ liệu của nhóm có thể được đọcở đây.